Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS2P35442 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS2P35442 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS2P35442 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS2P35442 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS2P35442 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS2P35442 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS2P35442 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS2P35442 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THBS2P35442 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS2P35442 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS2P35442 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS2P35442 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS2P35442 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS2P35442 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS2P35442 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS2P35442 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS2P35442 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THBS2P35442 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THBS2P35442 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS2P35442 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS2P35442 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS2P35442 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS2P35442 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS2P35442 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS2P35442 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS2P35442 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS2P35442 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS2P35442 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS2P35442 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS2P35442 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS2P35442 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS2P35442 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS2P35442 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS2P35442 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS2P35442 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS2P35442 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS2P35442 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS2P35442 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS2P35442 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS2P35442 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS2P35442 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS2P35442 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS2P35442 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS2P35442 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS2P35442 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS2P35442 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS2P35442 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS2P35442 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS2P35442 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS2P35442 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS2P35442 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS2P35442 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS2P35442 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS2P35442 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS2P35442 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS2P35442 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS2P35442 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS2P35442 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS2P35442 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS2P35442 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS2P35442 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS2P35442 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS2P35442 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS2P35442 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS2P35442 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS2P35442 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS2P35442 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS2P35442 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS2P35442 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS2P35442 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS2P35442 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS2P35442 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS2P35442 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS2P35442 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS2P35442 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS2P35442 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS2P35442 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS2P35442 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS2P35442 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS2P35442 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS2P35442 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS2P35442 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS2P35442 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS2P35442 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS2P35442 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS2P35442 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS2P35442 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS2P35442 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS2P35442 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS2P35442 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS2P35442 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS2P35442 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS2P35442 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS2P35442 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS2P35442 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS2P35442 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THBS2P35442 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THBS2P35442 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THBS2P35442 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms