Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPOP30536 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPOP30536 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPOP30536 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPOP30536 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPOP30536 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPOP30536 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPOP30536 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPOP30536 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPOP30536 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPOP30536 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSPOP30536 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSPOP30536 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSPOP30536 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSPOP30536 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSPOP30536 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSPOP30536 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSPOP30536 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSPOP30536 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSPOP30536 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSPOP30536 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TSPOP30536 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSPOP30536 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSPOP30536 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSPOP30536 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TSPOP30536 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSPOP30536 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSPOP30536 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSPOP30536 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSPOP30536 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSPOP30536 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSPOP30536 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSPOP30536 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSPOP30536 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSPOP30536 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSPOP30536 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSPOP30536 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPOP30536 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPOP30536 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPOP30536 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPOP30536 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPOP30536 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPOP30536 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPOP30536 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPOP30536 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPOP30536 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPOP30536 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPOP30536 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPOP30536 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TSPOP30536 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPOP30536 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPOP30536 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPOP30536 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPOP30536 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPOP30536 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPOP30536 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPOP30536 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPOP30536 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPOP30536 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPOP30536 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPOP30536 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPOP30536 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPOP30536 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPOP30536 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPOP30536 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPOP30536 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPOP30536 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPOP30536 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPOP30536 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPOP30536 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPOP30536 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPOP30536 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPOP30536 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPOP30536 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPOP30536 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPOP30536 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPOP30536 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPOP30536 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPOP30536 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 443.1 ms