Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMLP29590 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMLP29590 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMLP29590 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMLP29590 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMLP29590 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMLP29590 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMLP29590 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMLP29590 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMLP29590 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMLP29590 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMLP29590 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMLP29590 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PMLP29590 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMLP29590 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMLP29590 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMLP29590 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMLP29590 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PMLP29590 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMLP29590 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PMLP29590 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PMLP29590 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PMLP29590 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMLP29590 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMLP29590 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMLP29590 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMLP29590 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMLP29590 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PMLP29590 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMLP29590 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMLP29590 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMLP29590 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMLP29590 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMLP29590 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PMLP29590 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMLP29590 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMLP29590 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMLP29590 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMLP29590 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMLP29590 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMLP29590 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMLP29590 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMLP29590 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMLP29590 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMLP29590 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMLP29590 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMLP29590 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMLP29590 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMLP29590 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMLP29590 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMLP29590 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMLP29590 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMLP29590 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMLP29590 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMLP29590 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMLP29590 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMLP29590 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMLP29590 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMLP29590 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMLP29590 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMLP29590 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMLP29590 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMLP29590 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMLP29590 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMLP29590 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMLP29590 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMLP29590 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMLP29590 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMLP29590 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMLP29590 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMLP29590 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMLP29590 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMLP29590 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMLP29590 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMLP29590 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PMLP29590 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMLP29590 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PMLP29590 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMLP29590 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMLP29590 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PMLP29590 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMLP29590 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMLP29590 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMLP29590 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMLP29590 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PMLP29590 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMLP29590 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMLP29590 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMLP29590 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PMLP29590 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMLP29590 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PMLP29590 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMLP29590 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMLP29590 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMLP29590 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMLP29590 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMLP29590 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMLP29590 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMLP29590 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMLP29590 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms