Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1EP28566 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HTR1EP28566 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1EP28566 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTR1EP28566 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1EP28566 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1EP28566 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1EP28566 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1EP28566 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1EP28566 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1EP28566 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR1EP28566 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR1EP28566 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms