Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VARSP26640 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VARSP26640 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARSP26640 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARSP26640 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARSP26640 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARSP26640 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARSP26640 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARSP26640 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARSP26640 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARSP26640 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VARSP26640 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VARSP26640 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VARSP26640 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VARSP26640 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARSP26640 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARSP26640 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARSP26640 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VARSP26640 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VARSP26640 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VARSP26640 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VARSP26640 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VARSP26640 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VARSP26640 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARSP26640 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VARSP26640 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VARSP26640 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VARSP26640 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VARSP26640 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VARSP26640 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VARSP26640 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VARSP26640 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VARSP26640 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VARSP26640 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VARSP26640 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VARSP26640 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VARSP26640 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VARSP26640 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VARSP26640 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VARSP26640 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VARSP26640 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VARSP26640 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VARSP26640 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VARSP26640 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VARSP26640 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VARSP26640 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VARSP26640 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VARSP26640 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VARSP26640 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VARSP26640 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VARSP26640 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VARSP26640 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VARSP26640 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VARSP26640 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VARSP26640 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VARSP26640 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VARSP26640 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VARSP26640 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VARSP26640 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VARSP26640 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VARSP26640 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VARSP26640 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VARSP26640 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VARSP26640 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VARSP26640 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VARSP26640 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VARSP26640 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VARSP26640 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VARSP26640 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VARSP26640 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VARSP26640 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VARSP26640 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VARSP26640 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VARSP26640 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VARSP26640 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VARSP26640 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VARSP26640 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VARSP26640 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VARSP26640 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VARSP26640 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VARSP26640 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VARSP26640 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VARSP26640 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VARSP26640 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VARSP26640 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VARSP26640 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VARSP26640 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VARSP26640 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VARSP26640 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VARSP26640 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms