Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6AP20340 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6AP20340 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6AP20340 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6AP20340 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms