Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELK1P19419 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELK1P19419 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK1P19419 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK1P19419 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK1P19419 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK1P19419 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK1P19419 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK1P19419 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK1P19419 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK1P19419 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK1P19419 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK1P19419 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK1P19419 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK1P19419 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK1P19419 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK1P19419 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK1P19419 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK1P19419 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK1P19419 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK1P19419 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELK1P19419 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELK1P19419 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELK1P19419 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELK1P19419 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK1P19419 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK1P19419 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK1P19419 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK1P19419 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK1P19419 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK1P19419 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK1P19419 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK1P19419 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK1P19419 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK1P19419 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK1P19419 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK1P19419 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK1P19419 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK1P19419 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK1P19419 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK1P19419 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK1P19419 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK1P19419 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK1P19419 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK1P19419 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK1P19419 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK1P19419 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ELK1P19419 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK1P19419 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK1P19419 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK1P19419 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK1P19419 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK1P19419 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK1P19419 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK1P19419 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK1P19419 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK1P19419 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELK1P19419 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELK1P19419 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELK1P19419 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELK1P19419 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELK1P19419 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELK1P19419 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELK1P19419 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELK1P19419 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELK1P19419 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELK1P19419 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELK1P19419 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ELK1P19419 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELK1P19419 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELK1P19419 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELK1P19419 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELK1P19419 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELK1P19419 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELK1P19419 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELK1P19419 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELK1P19419 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ELK1P19419 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ELK1P19419 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELK1P19419 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELK1P19419 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELK1P19419 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELK1P19419 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELK1P19419 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELK1P19419 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELK1P19419 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELK1P19419 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELK1P19419 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELK1P19419 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELK1P19419 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELK1P19419 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELK1P19419 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK1P19419 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK1P19419 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK1P19419 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK1P19419 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK1P19419 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK1P19419 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK1P19419 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK1P19419 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1199.9 ms