Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT4P19013 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT4P19013 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT4P19013 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT4P19013 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT4P19013 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT4P19013 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT4P19013 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT4P19013 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT4P19013 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT4P19013 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT4P19013 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT4P19013 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT4P19013 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT4P19013 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT4P19013 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT4P19013 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT4P19013 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT4P19013 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT4P19013 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT4P19013 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT4P19013 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT4P19013 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT4P19013 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT4P19013 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT4P19013 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT4P19013 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT4P19013 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT4P19013 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT4P19013 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT4P19013 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT4P19013 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT4P19013 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT4P19013 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT4P19013 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT4P19013 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT4P19013 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT4P19013 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT4P19013 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT4P19013 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT4P19013 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT4P19013 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT4P19013 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT4P19013 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT4P19013 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT4P19013 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT4P19013 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT4P19013 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT4P19013 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT4P19013 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT4P19013 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT4P19013 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT4P19013 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT4P19013 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT4P19013 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT4P19013 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT4P19013 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT4P19013 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT4P19013 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT4P19013 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT4P19013 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT4P19013 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT4P19013 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT4P19013 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT4P19013 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT4P19013 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT4P19013 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT4P19013 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT4P19013 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT4P19013 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT4P19013 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT4P19013 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT4P19013 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT4P19013 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT4P19013 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT4P19013 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT4P19013 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT4P19013 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT4P19013 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT4P19013 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT4P19013 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT4P19013 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT4P19013 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT4P19013 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT4P19013 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT4P19013 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT4P19013 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT4P19013 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT4P19013 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT4P19013 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT4P19013 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT4P19013 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT4P19013 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT4P19013 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT4P19013 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT4P19013 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT4P19013 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT4P19013 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT4P19013 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT4P19013 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms