Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XRCC1P18887 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC1P18887 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms