Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACAP17612 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACAP17612 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACAP17612 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms