Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB1P14653 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB1P14653 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB1P14653 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms