Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSIG10L2P0DP72 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSIG10L2P0DP72 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VSIG10L2P0DP72 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSIG10L2P0DP72 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSIG10L2P0DP72 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VSIG10L2P0DP72 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VSIG10L2P0DP72 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSIG10L2P0DP72 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSIG10L2P0DP72 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.33■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VSIG10L2P0DP72 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms