Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD55P08174 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD55P08174 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD55P08174 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD55P08174 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD55P08174 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD55P08174 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD55P08174 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD55P08174 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD55P08174 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD55P08174 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD55P08174 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD55P08174 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD55P08174 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD55P08174 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD55P08174 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD55P08174 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD55P08174 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD55P08174 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD55P08174 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD55P08174 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD55P08174 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD55P08174 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD55P08174 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD55P08174 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD55P08174 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD55P08174 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD55P08174 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD55P08174 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD55P08174 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD55P08174 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD55P08174 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD55P08174 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD55P08174 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD55P08174 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD55P08174 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD55P08174 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD55P08174 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD55P08174 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD55P08174 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD55P08174 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD55P08174 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CD55P08174 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD55P08174 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD55P08174 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD55P08174 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD55P08174 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD55P08174 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CD55P08174 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CD55P08174 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD55P08174 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD55P08174 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD55P08174 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD55P08174 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CD55P08174 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD55P08174 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD55P08174 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD55P08174 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD55P08174 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD55P08174 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD55P08174 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD55P08174 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD55P08174 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD55P08174 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD55P08174 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD55P08174 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD55P08174 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD55P08174 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD55P08174 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD55P08174 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD55P08174 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD55P08174 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD55P08174 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD55P08174 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD55P08174 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD55P08174 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms