Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GP1BAP07359 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GP1BAP07359 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GP1BAP07359 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GP1BAP07359 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms