Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA4P05014 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms