Protein–RNA interactions for Protein: P04196

HRG, Histidine-rich glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRGP04196 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HRGP04196 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRGP04196 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRGP04196 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRGP04196 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRGP04196 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRGP04196 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRGP04196 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRGP04196 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRGP04196 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRGP04196 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRGP04196 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRGP04196 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRGP04196 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRGP04196 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRGP04196 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRGP04196 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRGP04196 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRGP04196 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRGP04196 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HRGP04196 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HRGP04196 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HRGP04196 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HRGP04196 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HRGP04196 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HRGP04196 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRGP04196 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRGP04196 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRGP04196 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRGP04196 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRGP04196 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRGP04196 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRGP04196 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRGP04196 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRGP04196 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRGP04196 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRGP04196 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRGP04196 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRGP04196 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRGP04196 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRGP04196 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRGP04196 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRGP04196 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRGP04196 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRGP04196 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRGP04196 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRGP04196 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRGP04196 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRGP04196 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRGP04196 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRGP04196 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HRGP04196 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRGP04196 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HRGP04196 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HRGP04196 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HRGP04196 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRGP04196 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRGP04196 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRGP04196 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HRGP04196 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRGP04196 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRGP04196 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRGP04196 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRGP04196 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRGP04196 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRGP04196 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRGP04196 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRGP04196 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HRGP04196 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HRGP04196 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HRGP04196 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HRGP04196 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HRGP04196 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HRGP04196 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms