Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC3P02656 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC3P02656 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC3P02656 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC3P02656 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC3P02656 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC3P02656 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC3P02656 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC3P02656 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC3P02656 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC3P02656 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC3P02656 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC3P02656 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC3P02656 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC3P02656 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC3P02656 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC3P02656 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC3P02656 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC3P02656 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC3P02656 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC3P02656 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC3P02656 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC3P02656 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC3P02656 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC3P02656 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC3P02656 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC3P02656 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC3P02656 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC3P02656 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC3P02656 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC3P02656 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC3P02656 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC3P02656 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC3P02656 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC3P02656 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC3P02656 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC3P02656 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC3P02656 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC3P02656 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC3P02656 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC3P02656 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC3P02656 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC3P02656 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC3P02656 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC3P02656 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC3P02656 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC3P02656 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC3P02656 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC3P02656 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC3P02656 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC3P02656 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC3P02656 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC3P02656 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC3P02656 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC3P02656 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC3P02656 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC3P02656 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC3P02656 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC3P02656 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC3P02656 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC3P02656 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC3P02656 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC3P02656 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC3P02656 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC3P02656 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC3P02656 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC3P02656 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC3P02656 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC3P02656 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC3P02656 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC3P02656 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC3P02656 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC3P02656 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC3P02656 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC3P02656 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC3P02656 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC3P02656 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC3P02656 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC3P02656 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC3P02656 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC3P02656 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC3P02656 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC3P02656 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC3P02656 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC3P02656 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC3P02656 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC3P02656 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC3P02656 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC3P02656 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC3P02656 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC3P02656 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC3P02656 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC3P02656 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC3P02656 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC3P02656 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC3P02656 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC3P02656 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC3P02656 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC3P02656 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC3P02656 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms