Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGDSO95455 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TGDSO95455 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGDSO95455 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGDSO95455 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TGDSO95455 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGDSO95455 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGDSO95455 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGDSO95455 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGDSO95455 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGDSO95455 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGDSO95455 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGDSO95455 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGDSO95455 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGDSO95455 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGDSO95455 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGDSO95455 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGDSO95455 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGDSO95455 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGDSO95455 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGDSO95455 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGDSO95455 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGDSO95455 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGDSO95455 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGDSO95455 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGDSO95455 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGDSO95455 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGDSO95455 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGDSO95455 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TGDSO95455 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGDSO95455 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGDSO95455 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGDSO95455 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TGDSO95455 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGDSO95455 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGDSO95455 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGDSO95455 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGDSO95455 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGDSO95455 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGDSO95455 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TGDSO95455 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TGDSO95455 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TGDSO95455 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TGDSO95455 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TGDSO95455 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TGDSO95455 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TGDSO95455 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TGDSO95455 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGDSO95455 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGDSO95455 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGDSO95455 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGDSO95455 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGDSO95455 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGDSO95455 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGDSO95455 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TGDSO95455 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGDSO95455 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGDSO95455 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGDSO95455 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGDSO95455 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TGDSO95455 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGDSO95455 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGDSO95455 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGDSO95455 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGDSO95455 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGDSO95455 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGDSO95455 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGDSO95455 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TGDSO95455 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGDSO95455 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGDSO95455 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGDSO95455 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGDSO95455 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGDSO95455 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGDSO95455 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGDSO95455 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGDSO95455 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGDSO95455 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGDSO95455 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGDSO95455 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGDSO95455 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGDSO95455 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGDSO95455 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGDSO95455 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TGDSO95455 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TGDSO95455 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGDSO95455 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGDSO95455 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGDSO95455 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGDSO95455 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGDSO95455 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGDSO95455 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGDSO95455 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGDSO95455 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGDSO95455 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TGDSO95455 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TGDSO95455 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGDSO95455 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGDSO95455 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGDSO95455 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.4 ms