Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCC1O94876 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCC1O94876 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCC1O94876 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms