Protein–RNA interactions for Protein: O75394

MRPL33, 39S ribosomal protein L33, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL33O75394 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL33O75394 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL33O75394 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL33O75394 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL33O75394 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL33O75394 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL33O75394 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL33O75394 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms