Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP12O75317 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP12O75317 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP12O75317 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP12O75317 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP12O75317 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP12O75317 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP12O75317 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP12O75317 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP12O75317 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP12O75317 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP12O75317 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP12O75317 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP12O75317 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP12O75317 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP12O75317 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP12O75317 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP12O75317 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP12O75317 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP12O75317 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP12O75317 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP12O75317 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP12O75317 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP12O75317 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP12O75317 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP12O75317 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP12O75317 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP12O75317 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP12O75317 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP12O75317 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP12O75317 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP12O75317 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP12O75317 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP12O75317 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP12O75317 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP12O75317 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP12O75317 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP12O75317 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP12O75317 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP12O75317 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP12O75317 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP12O75317 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP12O75317 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP12O75317 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
USP12O75317 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP12O75317 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP12O75317 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP12O75317 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP12O75317 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP12O75317 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP12O75317 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP12O75317 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP12O75317 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP12O75317 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP12O75317 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP12O75317 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP12O75317 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP12O75317 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP12O75317 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP12O75317 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP12O75317 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP12O75317 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP12O75317 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP12O75317 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP12O75317 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP12O75317 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP12O75317 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP12O75317 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP12O75317 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP12O75317 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP12O75317 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP12O75317 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP12O75317 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP12O75317 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP12O75317 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP12O75317 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP12O75317 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP12O75317 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP12O75317 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP12O75317 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP12O75317 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP12O75317 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP12O75317 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP12O75317 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP12O75317 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP12O75317 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP12O75317 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP12O75317 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP12O75317 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP12O75317 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP12O75317 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP12O75317 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP12O75317 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP12O75317 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP12O75317 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP12O75317 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP12O75317 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP12O75317 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP12O75317 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP12O75317 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms