Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTIPO60759 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTIPO60759 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTIPO60759 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms