Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC51.82■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC51.82■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC51.81■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.8■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC51.8■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC51.79■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.77■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC51.77■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC51.76■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC51.76■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.76■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC51.75■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC51.75■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.88
ABCC9O60706 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.73■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC51.73■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC51.72■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC51.72■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC51.71■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC51.69■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC51.69■■■■■ 5.87
ABCC9O60706 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC51.68■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC51.68■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.67■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
ABCC9O60706 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC51.61■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.59■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC51.58■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC9O60706 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC51.56■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.55■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.54■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC51.52■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.84
ABCC9O60706 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC51.49■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC51.48■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.48■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.47■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.46■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.46■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
ABCC9O60706 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC51.43■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC51.42■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC51.42■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC51.42■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC51.4■■■■■ 5.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms