Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSCO60682 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSCO60682 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSCO60682 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSCO60682 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSCO60682 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSCO60682 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSCO60682 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSCO60682 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSCO60682 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSCO60682 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSCO60682 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MSCO60682 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MSCO60682 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSCO60682 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSCO60682 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSCO60682 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSCO60682 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSCO60682 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSCO60682 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSCO60682 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSCO60682 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSCO60682 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSCO60682 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSCO60682 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSCO60682 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSCO60682 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSCO60682 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSCO60682 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSCO60682 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSCO60682 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MSCO60682 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MSCO60682 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSCO60682 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MSCO60682 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSCO60682 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSCO60682 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSCO60682 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSCO60682 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSCO60682 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSCO60682 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSCO60682 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSCO60682 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSCO60682 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSCO60682 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSCO60682 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSCO60682 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSCO60682 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSCO60682 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSCO60682 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSCO60682 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSCO60682 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSCO60682 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSCO60682 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSCO60682 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSCO60682 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MSCO60682 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MSCO60682 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MSCO60682 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MSCO60682 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MSCO60682 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MSCO60682 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MSCO60682 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MSCO60682 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSCO60682 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSCO60682 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSCO60682 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MSCO60682 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSCO60682 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MSCO60682 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSCO60682 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSCO60682 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSCO60682 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSCO60682 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSCO60682 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MSCO60682 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MSCO60682 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MSCO60682 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MSCO60682 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MSCO60682 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MSCO60682 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MSCO60682 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSCO60682 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSCO60682 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSCO60682 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSCO60682 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSCO60682 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSCO60682 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSCO60682 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSCO60682 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSCO60682 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSCO60682 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MSCO60682 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MSCO60682 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSCO60682 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSCO60682 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSCO60682 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSCO60682 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSCO60682 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSCO60682 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms