Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP9O43818 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP9O43818 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP9O43818 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP9O43818 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP9O43818 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP9O43818 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP9O43818 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP9O43818 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP9O43818 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP9O43818 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP9O43818 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP9O43818 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP9O43818 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP9O43818 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP9O43818 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP9O43818 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP9O43818 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP9O43818 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP9O43818 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP9O43818 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP9O43818 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP9O43818 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP9O43818 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP9O43818 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP9O43818 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP9O43818 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP9O43818 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP9O43818 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP9O43818 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP9O43818 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP9O43818 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP9O43818 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP9O43818 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP9O43818 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP9O43818 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP9O43818 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP9O43818 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP9O43818 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP9O43818 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP9O43818 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP9O43818 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP9O43818 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP9O43818 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP9O43818 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP9O43818 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP9O43818 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP9O43818 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP9O43818 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP9O43818 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP9O43818 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP9O43818 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP9O43818 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP9O43818 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP9O43818 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP9O43818 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP9O43818 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP9O43818 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP9O43818 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP9O43818 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP9O43818 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP9O43818 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP9O43818 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP9O43818 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP9O43818 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP9O43818 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP9O43818 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP9O43818 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP9O43818 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP9O43818 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP9O43818 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP9O43818 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP9O43818 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP9O43818 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP9O43818 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP9O43818 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP9O43818 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP9O43818 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP9O43818 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP9O43818 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP9O43818 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP9O43818 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP9O43818 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP9O43818 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP9O43818 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP9O43818 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP9O43818 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP9O43818 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP9O43818 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP9O43818 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP9O43818 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP9O43818 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP9O43818 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP9O43818 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP9O43818 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP9O43818 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP9O43818 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP9O43818 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP9O43818 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP9O43818 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms