Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTRA2O43464 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA2O43464 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTRA2O43464 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms