Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBFA2T2O43439 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CBFA2T2O43439 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms