Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 CDK2AP1-206ENST00000544658 931 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.227e-26■■■■■ 46.1
RBFOX2O43251 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.814e-14■■■■■ 46.1
RBFOX2O43251 CELF1-213ENST00000530151 583 ntTSL 316.76■□□□□ 0.277e-10■■■■■ 46.1
RBFOX2O43251 CELF1-210ENST00000526419 476 ntTSL 413.96□□□□□ -0.177e-10■■■■■ 46.1
RBFOX2O43251 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.57e-10■■■■■ 46.1
RBFOX2O43251 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.527e-10■■■■■ 46.1
RBFOX2O43251 CELF1-208ENST00000525841 622 ntTSL 511.36□□□□□ -0.597e-10■■■■■ 46.1
RBFOX2O43251 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.628e-10■■■■■ 46
RBFOX2O43251 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 516.16■□□□□ 0.188e-10■■■■■ 46
RBFOX2O43251 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.118e-10■■■■■ 46
RBFOX2O43251 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.674e-6■■■■■ 46
RBFOX2O43251 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-23■■■■■ 45.9
RBFOX2O43251 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21e-23■■■■■ 45.9
RBFOX2O43251 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.787e-13■■■■■ 45.9
RBFOX2O43251 AKR1B10-202ENST00000475559 869 ntTSL 59.93□□□□□ -0.827e-13■■■■■ 45.9
RBFOX2O43251 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.43e-8■■■■■ 45.8
RBFOX2O43251 LETM1-205ENST00000511977 746 ntTSL 213.82□□□□□ -0.26e-8■■■■■ 45.7
RBFOX2O43251 FAM171A1-202ENST00000455654 605 ntTSL 312.65□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 45.7
RBFOX2O43251 IDUA-202ENST00000502829 558 ntTSL 221.48■■□□□ 1.033e-17■■■■■ 45.7
RBFOX2O43251 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.185e-24■■■■■ 45.6
RBFOX2O43251 CTSL-206ENST00000495822 988 ntTSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.65e-24■■■■■ 45.6
RBFOX2O43251 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.625e-24■■■■■ 45.6
RBFOX2O43251 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 33.3□□□□□ -1.883e-9■■■■■ 45.5
RBFOX2O43251 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 45.5
RBFOX2O43251 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 45.5
RBFOX2O43251 POMK-202ENST00000518991 564 ntTSL 46.76□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 45.5
RBFOX2O43251 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-22■■■■■ 45.4
RBFOX2O43251 NRBP2-205ENST00000530123 925 ntTSL 1 (best)19.27■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 45.3
RBFOX2O43251 NRBP2-203ENST00000527545 2546 ntTSL 216.9■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 45.3
RBFOX2O43251 NRBP2-201ENST00000423469 2905 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 45.3
RBFOX2O43251 ARFGAP1-205ENST00000468975 2640 ntTSL 214.33□□□□□ -0.121e-38■■■■■ 45.3
RBFOX2O43251 TOP1MT-210ENST00000519977 892 ntTSL 312.48□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 45.2
RBFOX2O43251 TOP1MT-203ENST00000517857 624 ntTSL 211.39□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 45.2
RBFOX2O43251 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 45.1
RBFOX2O43251 B3GNTL1-203ENST00000571218 459 ntTSL 29.13□□□□□ -0.952e-11■■■■■ 45.1
RBFOX2O43251 KLHDC4-223ENST00000568499 445 ntTSL 311.9□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 45.1
RBFOX2O43251 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 45
RBFOX2O43251 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.351e-16■■■■■ 45
RBFOX2O43251 RASGRF2-201ENST00000265080 8167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.851e-16■■■■■ 45
RBFOX2O43251 RASGRF2-203ENST00000503795 3837 ntTSL 1 (best)9.63□□□□□ -0.871e-16■■■■■ 45
RBFOX2O43251 RASGRF2-202ENST00000502677 2752 ntTSL 28.62□□□□□ -1.031e-16■■■■■ 45
RBFOX2O43251 RASGRF2-205ENST00000514946 548 ntTSL 58.44□□□□□ -1.061e-16■■■■■ 45
RBFOX2O43251 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -11e-9■■■■■ 44.9
RBFOX2O43251 PLOD1-209ENST00000491536 639 ntTSL 38.6□□□□□ -1.033e-9■■■■■ 44.9
RBFOX2O43251 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.914e-13■■■■■ 44.8
RBFOX2O43251 ARFGAP1-208ENST00000518691 1162 ntTSL 214.65□□□□□ -0.062e-38■■■■■ 44.7
RBFOX2O43251 DNAJC11-204ENST00000451196 1357 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.159e-27■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.099e-27■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.719e-27■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 DNAJC11-210ENST00000473993 755 ntTSL 59.66□□□□□ -0.869e-27■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 DNAJC11-203ENST00000426784 975 ntTSL 35.96□□□□□ -1.469e-27■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 OSGIN1-207ENST00000567707 534 ntTSL 46.73□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 OSGIN1-204ENST00000561552 434 ntTSL 55.5□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 ARFGAP1-209ENST00000518794 2727 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.011e-38■■■■■ 44.4
RBFOX2O43251 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 44.2
RBFOX2O43251 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 44.2
RBFOX2O43251 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 44.2
RBFOX2O43251 MBNL2-205ENST00000449284 581 ntTSL 22.83□□□□□ -1.968e-12■■■■■ 44.1
RBFOX2O43251 WDR90-207ENST00000547407 3847 ntTSL 211.23□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 44.1
RBFOX2O43251 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)12.07□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 SH3BP2-217ENST00000510204 3617 ntTSL 210.39□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC10.97□□□□□ -0.652e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt8.97□□□□□ -0.972e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt8.96□□□□□ -0.982e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.32e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.252e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.242e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.242e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-215ENST00000438863 1005 ntTSL 519.99■□□□□ 0.792e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 NDUFB1-205ENST00000556555 568 ntTSL 317.28■□□□□ 0.362e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.432e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.912e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-OT4-202ENST00000397751 754 ntTSL 37.51□□□□□ -1.212e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 NDUFB1-206ENST00000605997 336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.212e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-217ENST00000446490 1694 ntTSL 56.68□□□□□ -1.342e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-216ENST00000443979 805 ntTSL 56.12□□□□□ -1.432e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-209ENST00000417919 577 ntTSL 43.59□□□□□ -1.832e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-OT4-205ENST00000471110 591 ntTSL 42.9□□□□□ -1.952e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-211ENST00000421345 531 ntTSL 42.47□□□□□ -2.012e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 ST7-OT4-204ENST00000470996 416 ntTSL 22.43□□□□□ -2.022e-12■■■■■ 43.7
RBFOX2O43251 VAV2-205ENST00000486113 523 ntTSL 29.83□□□□□ -0.844e-8■■■■■ 43.6
RBFOX2O43251 KCNIP2-209ENST00000434163 534 ntTSL 1 (best)8.32□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 43.6
RBFOX2O43251 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.248e-8■■■■■ 43.6
RBFOX2O43251 KIAA0895L-211ENST00000568563 1977 ntTSL 515.41■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 43.6
RBFOX2O43251 KIAA0895L-203ENST00000561679 2824 ntTSL 213.29□□□□□ -0.288e-8■■■■■ 43.6
RBFOX2O43251 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.448e-8■■■■■ 43.6
RBFOX2O43251 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.498e-8■■■■■ 43.6
RBFOX2O43251 KIAA0895L-212ENST00000570009 680 ntTSL 411.12□□□□□ -0.638e-8■■■■■ 43.6
RBFOX2O43251 KIAA0895L-205ENST00000563831 836 ntTSL 410.51□□□□□ -0.738e-8■■■■■ 43.6
RBFOX2O43251 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)18.52■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 43.3
RBFOX2O43251 PRKCZ-215ENST00000479263 1747 ntTSL 217.59■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 43.3
RBFOX2O43251 PRKCZ-226ENST00000505322 1859 ntTSL 215.42■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 43.3
Retrieved 100 of 22,255 protein–RNA pairs in 62.1 ms