RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438863.5

ST7-215, Transcript of suppression of tumorigenicity 7, humanhuman

TSL 5

Gene ST7, Length 1,005 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST7-215ENST00000438863 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.14■■■■■ 8.34
ST7-215ENST00000438863 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.31■■■■■ 7.24
ST7-215ENST00000438863 ABCC9O60706 1549 aa59.98■■■■■ 7.19
ST7-215ENST00000438863 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.23■■■■■ 6.75
ST7-215ENST00000438863 NACADO15069 1562 aa56.89■■■■■ 6.7
ST7-215ENST00000438863 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.28■■■■■ 6.6
ST7-215ENST00000438863 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.21■■■■■ 6.59
ST7-215ENST00000438863 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.15■■■■■ 6.58
ST7-215ENST00000438863 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.12■■■■■ 6.57
ST7-215ENST00000438863 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.77■■■■■ 6.52
ST7-215ENST00000438863 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.71■■■■■ 6.51
ST7-215ENST00000438863 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.65■■■■■ 6.5
ST7-215ENST00000438863 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.53■■■■■ 6.48
ST7-215ENST00000438863 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.88■■■■■ 6.38
ST7-215ENST00000438863 SCRIBQ14160 1630 aa54.84■■■■■ 6.37
ST7-215ENST00000438863 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.29■■■■■ 6.28
ST7-215ENST00000438863 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.21■■■■■ 6.27
ST7-215ENST00000438863 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.03■■■■■ 6.24
ST7-215ENST00000438863 NCAPD3P42695 1498 aa52.5■■■■■ 5.99
ST7-215ENST00000438863 SMARCA4P51532 1647 aa52.39■■■■■ 5.98
ST7-215ENST00000438863 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.35■■■■■ 5.97
ST7-215ENST00000438863 SMARCA2P51531 1590 aa52.21■■■■■ 5.95
ST7-215ENST00000438863 HMGXB3Q12766 1538 aa52.17■■■■■ 5.94
ST7-215ENST00000438863 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.1■■■■■ 5.93
ST7-215ENST00000438863 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.94■■■■■ 5.91
ST7-215ENST00000438863 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.8■■■■■ 5.88
ST7-215ENST00000438863 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.74■■■■■ 5.87
ST7-215ENST00000438863 ERCC6Q03468 1493 aa51.72■■■■■ 5.87
ST7-215ENST00000438863 CUX2O14529 1486 aa51.69■■■■■ 5.87
ST7-215ENST00000438863 NESP48681 1621 aa51.61■■■■■ 5.85
ST7-215ENST00000438863 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.43■■■■■ 5.82
ST7-215ENST00000438863 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.32■■■■■ 5.81
ST7-215ENST00000438863 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.18■■■■■ 5.78
ST7-215ENST00000438863 WIZO95785 1651 aa51.15■■■■■ 5.78
ST7-215ENST00000438863 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.06■■■■■ 5.76
ST7-215ENST00000438863 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.9■■■■■ 5.74
ST7-215ENST00000438863 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.84■■■■■ 5.73
ST7-215ENST00000438863 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.68■■■■■ 5.7
ST7-215ENST00000438863 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.52■■■■■ 5.68
ST7-215ENST00000438863 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.51■■■■■ 5.68
ST7-215ENST00000438863 WDR62O43379 1518 aa50.46■■■■■ 5.67
ST7-215ENST00000438863 CFTRP13569 1480 aa50.35■■■■■ 5.65
ST7-215ENST00000438863 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.33■■■■■ 5.65
ST7-215ENST00000438863 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.28■■■■■ 5.64
ST7-215ENST00000438863 PRDM2Q13029 1718 aa50.04■■■■■ 5.6
ST7-215ENST00000438863 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.92■■■■■ 5.58
ST7-215ENST00000438863 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.88■■■■■ 5.58
ST7-215ENST00000438863 TOPBP1Q92547 1522 aa49.39■■■■■ 5.5
ST7-215ENST00000438863 IFT140Q96RY7 1462 aa49.32■■■■■ 5.49
ST7-215ENST00000438863 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.25■■■■■ 5.48
ST7-215ENST00000438863 ABCC8Q09428 1581 aa49.25■■■■■ 5.47
ST7-215ENST00000438863 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.24■■■■■ 5.47
ST7-215ENST00000438863 OSCARQ8IYS5 282 aa49.2■■■■■ 5.47
ST7-215ENST00000438863 TRIM41Q8WV44 630 aa49.1■■■■■ 5.45
ST7-215ENST00000438863 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.06■■■■■ 5.44
ST7-215ENST00000438863 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
ST7-215ENST00000438863 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.89■■■■■ 5.42
ST7-215ENST00000438863 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.77■■■■■ 5.4
ST7-215ENST00000438863 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.75■■■■■ 5.39
ST7-215ENST00000438863 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.75■■■■■ 5.39
ST7-215ENST00000438863 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.75■■■■■ 5.39
ST7-215ENST00000438863 CHD1O14646 1710 aa48.7■■■■■ 5.39
ST7-215ENST00000438863 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.67■■■■■ 5.38
ST7-215ENST00000438863 CUX1P39880 1505 aa48.6■■■■■ 5.37
ST7-215ENST00000438863 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.59■■■■■ 5.37
ST7-215ENST00000438863 SOGA1O94964 1423 aa48.58■■■■■ 5.37
ST7-215ENST00000438863 ARHGEF11O15085 1522 aa48.57■■■■■ 5.37
ST7-215ENST00000438863 WDR97A6NE52 1622 aa48.53■■■■■ 5.36
ST7-215ENST00000438863 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.46■■■■■ 5.35
ST7-215ENST00000438863 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.31■■■■■ 5.32
ST7-215ENST00000438863 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.31■■■■■ 5.32
ST7-215ENST00000438863 FBLN2P98095 1184 aa48.25■■■■■ 5.31
ST7-215ENST00000438863 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
ST7-215ENST00000438863 GRIN2BQ13224 1484 aa48.19■■■■■ 5.31
ST7-215ENST00000438863 PBRM1Q86U86 1689 aa48.15■■■■■ 5.3
ST7-215ENST00000438863 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.13■■■■■ 5.3
ST7-215ENST00000438863 ARAP1Q96P48 1450 aa48.11■■■■■ 5.29
ST7-215ENST00000438863 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.07■■■■■ 5.29
ST7-215ENST00000438863 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.07■■■■■ 5.29
ST7-215ENST00000438863 SYNJ2O15056 1496 aa48.04■■■■■ 5.28
ST7-215ENST00000438863 SYNJ1O43426 1573 aa48.03■■■■■ 5.28
ST7-215ENST00000438863 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.03■■■■■ 5.28
ST7-215ENST00000438863 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.02■■■■■ 5.28
ST7-215ENST00000438863 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
ST7-215ENST00000438863 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.94■■■■■ 5.26
ST7-215ENST00000438863 TOP2BQ02880 1626 aa47.89■■■■■ 5.26
ST7-215ENST00000438863 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.81■■■■■ 5.249e-6■■■■■ 50.1
ST7-215ENST00000438863 ADAMTS12P58397 1594 aa47.66■■■■■ 5.22
ST7-215ENST00000438863 GRIN2AQ12879 1464 aa47.6■■■■■ 5.21
ST7-215ENST00000438863 CEP170Q5SW79 1584 aa47.49■■■■■ 5.19
ST7-215ENST00000438863 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.47■■■■■ 5.19
ST7-215ENST00000438863 NUP160Q12769 1436 aa47.47■■■■■ 5.19
ST7-215ENST00000438863 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.43■■■■■ 5.18
ST7-215ENST00000438863 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
ST7-215ENST00000438863 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.37■■■■■ 5.17
ST7-215ENST00000438863 SHROOM2Q13796 1616 aa47.34■■■■■ 5.17
ST7-215ENST00000438863 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47■■■■■ 5.12
ST7-215ENST00000438863 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.9■■■■■ 5.1
ST7-215ENST00000438863 CUL7Q14999 1698 aa46.84■■■■■ 5.09
ST7-215ENST00000438863 KIF27Q86VH2 1401 aa46.83■■■■■ 5.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms