Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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TM9SF1O15321 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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TM9SF1O15321 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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TM9SF1O15321 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM9SF1O15321 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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TM9SF1O15321 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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TM9SF1O15321 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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TM9SF1O15321 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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TM9SF1O15321 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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TM9SF1O15321 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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TM9SF1O15321 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM9SF1O15321 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TM9SF1O15321 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF1O15321 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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