Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA5E9PKD4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPA5E9PKD4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA5E9PKD4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms