Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPIPB6E9PJ23 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB6E9PJ23 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB6E9PJ23 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms