Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBD1B2RD01 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBD1B2RD01 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBD1B2RD01 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms