Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRIQ3A6PVS8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ3A6PVS8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ3A6PVS8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms