Protein–RNA interactions for Protein: A6NG13

MGAT4D, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein MGAT4D, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4DA6NG13 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT4DA6NG13 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MGAT4DA6NG13 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MGAT4DA6NG13 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MGAT4DA6NG13 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MGAT4DA6NG13 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGAT4DA6NG13 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGAT4DA6NG13 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGAT4DA6NG13 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGAT4DA6NG13 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGAT4DA6NG13 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGAT4DA6NG13 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGAT4DA6NG13 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms