Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C5orf60A6NFR6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf60A6NFR6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf60A6NFR6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms