Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTAGE9A4FU28 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTAGE9A4FU28 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTAGE9A4FU28 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms