Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISPDA4D126 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISPDA4D126 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ISPDA4D126 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ISPDA4D126 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ISPDA4D126 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ISPDA4D126 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms