RNA–Protein interactions for RNA: YOL050C

YOL050C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YOL050C, Length 321 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOL050CYOL050C MTC1P47018 478 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
YOL050CYOL050C DRS1P32892 752 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
YOL050CYOL050C FAP1P53971 965 aa14.1□□□□□ -0.15
YOL050CYOL050C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
YOL050CYOL050C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
YOL050CYOL050C PRI1P10363 409 aa13.5□□□□□ -0.25
YOL050CYOL050C ISW2Q08773 1120 aa13.41□□□□□ -0.26
YOL050CYOL050C AVT3P36062 692 aa13.37□□□□□ -0.27
YOL050CYOL050C AAD16Q02895 342 aa13.33□□□□□ -0.28
YOL050CYOL050C RPG1P38249 964 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
YOL050CYOL050C PRY3P47033 881 aa13.25□□□□□ -0.29
YOL050CYOL050C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
YOL050CYOL050C TFA1P36100 482 aa12.91□□□□□ -0.34
YOL050CYOL050C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
YOL050CYOL050C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
YOL050CYOL050C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
YOL050CYOL050C YCK3P39962 524 aa12.6□□□□□ -0.39
YOL050CYOL050C REB1P21538 810 aa12.5□□□□□ -0.41
YOL050CYOL050C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
YOL050CYOL050C MRPL32P25348 183 aa12.26□□□□□ -0.45
YOL050CYOL050C SPT21P35209 758 aa12.15□□□□□ -0.46
YOL050CYOL050C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
YOL050CYOL050C RIM101P33400 625 aa11.84□□□□□ -0.51
YOL050CYOL050C CDC27P38042 758 aa11.81□□□□□ -0.52
YOL050CYOL050C HOP09932 586 aa11.67□□□□□ -0.54
YOL050CYOL050C TFC8Q12308 588 aa11.64□□□□□ -0.55
YOL050CYOL050C DCD1P06773 312 aa11.62□□□□□ -0.55
YOL050CYOL050C YGL015CP33199 130 aa11.59□□□□□ -0.55
YOL050CYOL050C OXP1P28273 1286 aa11.49□□□□□ -0.57
YOL050CYOL050C MAP2P38174 421 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
YOL050CYOL050C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
YOL050CYOL050C BCH2P36122 765 aa11.3□□□□□ -0.6
YOL050CYOL050C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
YOL050CYOL050C PTP3P40048 928 aa11.24□□□□□ -0.61
YOL050CYOL050C SCY1P53009 804 aa11.22□□□□□ -0.61
YOL050CYOL050C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
YOL050CYOL050C RSM7P47150 247 aa11.11□□□□□ -0.63
YOL050CYOL050C YLR271WQ06152 274 aa11.06□□□□□ -0.64
YOL050CYOL050C EPS1P40557 701 aa11.04□□□□□ -0.64
YOL050CYOL050C SSP1P38871 571 aa11.03□□□□□ -0.64
YOL050CYOL050C SLX5P32828 619 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
YOL050CYOL050C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
YOL050CYOL050C BDF1P35817 686 aa10.98□□□□□ -0.65
YOL050CYOL050C AI2P03876 854 aa10.97□□□□□ -0.65
YOL050CYOL050C BBC1P47068 1157 aa10.9□□□□□ -0.66
YOL050CYOL050C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data10.87□□□□□ -0.67not detected
YOL050CYOL050C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
YOL050CYOL050C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
YOL050CYOL050C TGL3P40308 642 aa10.8□□□□□ -0.68
YOL050CYOL050C CST9Q06032 482 aa10.7□□□□□ -0.7
YOL050CYOL050C MGA2P40578 1113 aa10.69□□□□□ -0.7
YOL050CYOL050C DMA1P38823 416 aa10.63□□□□□ -0.71
YOL050CYOL050C MRM1P25270 412 aa10.61□□□□□ -0.71
YOL050CYOL050C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data10.47□□□□□ -0.73not detected
YOL050CYOL050C MST1P07236 462 aa10.42□□□□□ -0.74
YOL050CYOL050C YAP5P40574 245 aa10.42□□□□□ -0.74
YOL050CYOL050C YOR238WQ08634 303 aa10.42□□□□□ -0.74
YOL050CYOL050C RCR1P38212 213 aa10.41□□□□□ -0.74
YOL050CYOL050C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
YOL050CYOL050C RTG3P38165 486 aa10.39□□□□□ -0.75
YOL050CYOL050C VPS29P38759 282 aa10.38□□□□□ -0.75
YOL050CYOL050C PIB1Q06651 286 aa10.32□□□□□ -0.76
YOL050CYOL050C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data10.29□□□□□ -0.76not detected
YOL050CYOL050C UBP9P39967 754 aa10.26□□□□□ -0.77
YOL050CYOL050C YFR006WP43590 535 aa10.26□□□□□ -0.77
YOL050CYOL050C DBP1P24784 617 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
YOL050CYOL050C STS1P38637 319 aa10.25□□□□□ -0.77
YOL050CYOL050C RAM2P29703 316 aa10.22□□□□□ -0.77
YOL050CYOL050C YBL029C-AQ3E756 94 aa10.19□□□□□ -0.78
YOL050CYOL050C GTT3P39996 337 aa10.15□□□□□ -0.78
YOL050CYOL050C WSC3Q12215 556 aa10.14□□□□□ -0.79
YOL050CYOL050C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
YOL050CYOL050C VNX1P42839 908 aa10.1□□□□□ -0.79
YOL050CYOL050C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
YOL050CYOL050C MAK11P20484 414 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
YOL050CYOL050C SPP1Q03012 353 aa10□□□□□ -0.81
YOL050CYOL050C SAM3Q08986 587 aa9.99□□□□□ -0.81
YOL050CYOL050C YOL036WQ08206 761 aa9.98□□□□□ -0.81
YOL050CYOL050C MIF2P35201 549 aa9.97□□□□□ -0.81
YOL050CYOL050C EDS1P38073 919 aa9.97□□□□□ -0.81
YOL050CYOL050C SET1P38827 1080 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
YOL050CYOL050C SET4P42948 560 aa9.97□□□□□ -0.81
YOL050CYOL050C COQ8P27697 501 aa9.96□□□□□ -0.82
YOL050CYOL050C TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
YOL050CYOL050C SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
YOL050CYOL050C MSB4Q12317 492 aa9.93□□□□□ -0.82
YOL050CYOL050C ULI1P43604 169 aa9.89□□□□□ -0.83
YOL050CYOL050C GYP5Q12344 894 aa9.89□□□□□ -0.83
YOL050CYOL050C PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
YOL050CYOL050C YPR148CQ06523 435 aa9.88□□□□□ -0.83
YOL050CYOL050C IOC2Q12072 812 aa9.86□□□□□ -0.83
YOL050CYOL050C TRP5P00931 707 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
YOL050CYOL050C IFH1P39520 1085 aa9.84□□□□□ -0.83
YOL050CYOL050C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
YOL050CYOL050C EAP1P36041 632 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
YOL050CYOL050C DCW1P36091 449 aa9.82□□□□□ -0.84
YOL050CYOL050C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
YOL050CYOL050C LDB19Q12502 818 aa9.81□□□□□ -0.84
YOL050CYOL050C LEU3P08638 886 aa9.78□□□□□ -0.84
YOL050CYOL050C CKB1P43639 278 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms