RNA–Protein interactions for RNA: YJL177W

RPL17B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L17B, yeastyeast

Gene RPL17B, Length 555 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BYJL177W MTC1P47018 478 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
RPL17BYJL177W DRS1P32892 752 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
RPL17BYJL177W FAP1P53971 965 aa9.61□□□□□ -0.87
RPL17BYJL177W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RPL17BYJL177W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RPL17BYJL177W PRY3P47033 881 aa9.06□□□□□ -0.96
RPL17BYJL177W AVT3P36062 692 aa9.05□□□□□ -0.96
RPL17BYJL177W PRI1P10363 409 aa8.93□□□□□ -0.98
RPL17BYJL177W AAD16Q02895 342 aa8.9□□□□□ -0.98
RPL17BYJL177W ISW2Q08773 1120 aa8.86□□□□□ -0.99
RPL17BYJL177W RPG1P38249 964 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RPL17BYJL177W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RPL17BYJL177W TFA1P36100 482 aa8.63□□□□□ -1.03
RPL17BYJL177W YCK3P39962 524 aa8.62□□□□□ -1.03
RPL17BYJL177W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RPL17BYJL177W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RPL17BYJL177W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RPL17BYJL177W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RPL17BYJL177W REB1P21538 810 aa8.33□□□□□ -1.08
RPL17BYJL177W MRPL32P25348 183 aa8.09□□□□□ -1.11
RPL17BYJL177W SPT21P35209 758 aa8.07□□□□□ -1.12
RPL17BYJL177W RIM101P33400 625 aa7.95□□□□□ -1.14
RPL17BYJL177W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RPL17BYJL177W YGL015CP33199 130 aa7.81□□□□□ -1.16
RPL17BYJL177W CDC27P38042 758 aa7.72□□□□□ -1.17
RPL17BYJL177W HOP09932 586 aa7.71□□□□□ -1.18
RPL17BYJL177W OXP1P28273 1286 aa7.71□□□□□ -1.18
RPL17BYJL177W TFC8Q12308 588 aa7.69□□□□□ -1.18
RPL17BYJL177W DCD1P06773 312 aa7.64□□□□□ -1.19
RPL17BYJL177W PTP3P40048 928 aa7.62□□□□□ -1.19
RPL17BYJL177W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RPL17BYJL177W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RPL17BYJL177W SSP1P38871 571 aa7.55□□□□□ -1.2
RPL17BYJL177W RSM7P47150 247 aa7.49□□□□□ -1.21
RPL17BYJL177W BCH2P36122 765 aa7.47□□□□□ -1.21
RPL17BYJL177W YLR271WQ06152 274 aa7.47□□□□□ -1.21
RPL17BYJL177W MAP2P38174 421 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RPL17BYJL177W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RPL17BYJL177W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.45□□□□□ -1.22not detected
RPL17BYJL177W SCY1P53009 804 aa7.38□□□□□ -1.23
RPL17BYJL177W AI2P03876 854 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL17BYJL177W EPS1P40557 701 aa7.33□□□□□ -1.24
RPL17BYJL177W BBC1P47068 1157 aa7.33□□□□□ -1.24
RPL17BYJL177W MGA2P40578 1113 aa7.3□□□□□ -1.24
RPL17BYJL177W BDF1P35817 686 aa7.28□□□□□ -1.24
RPL17BYJL177W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPL17BYJL177W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RPL17BYJL177W SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPL17BYJL177W CST9Q06032 482 aa7.24□□□□□ -1.25
RPL17BYJL177W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RPL17BYJL177W MRM1P25270 412 aa7.13□□□□□ -1.27
RPL17BYJL177W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RPL17BYJL177W TGL3P40308 642 aa7.12□□□□□ -1.27
RPL17BYJL177W DMA1P38823 416 aa7.08□□□□□ -1.28
RPL17BYJL177W RTG3P38165 486 aa7.04□□□□□ -1.28
RPL17BYJL177W RCR1P38212 213 aa7□□□□□ -1.29
RPL17BYJL177W RAM2P29703 316 aa6.96□□□□□ -1.3
RPL17BYJL177W VPS29P38759 282 aa6.96□□□□□ -1.3
RPL17BYJL177W UBP9P39967 754 aa6.93□□□□□ -1.3
RPL17BYJL177W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data6.92□□□□□ -1.3 RIP-Chip
RPL17BYJL177W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data6.92□□□□□ -1.3not detected
RPL17BYJL177W YAP5P40574 245 aa6.91□□□□□ -1.3
RPL17BYJL177W YOR238WQ08634 303 aa6.89□□□□□ -1.31
RPL17BYJL177W SIS1P25294 352 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RPL17BYJL177W DBP1P24784 617 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RPL17BYJL177W MAK11P20484 414 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RPL17BYJL177W STS1P38637 319 aa6.86□□□□□ -1.31
RPL17BYJL177W YFR006WP43590 535 aa6.86□□□□□ -1.31
RPL17BYJL177W MST1P07236 462 aa6.84□□□□□ -1.31
RPL17BYJL177W PIB1Q06651 286 aa6.84□□□□□ -1.31
RPL17BYJL177W SET1P38827 1080 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RPL17BYJL177W COQ8P27697 501 aa6.77□□□□□ -1.33
RPL17BYJL177W MIF2P35201 549 aa6.77□□□□□ -1.33
RPL17BYJL177W GTT3P39996 337 aa6.75□□□□□ -1.33
RPL17BYJL177W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RPL17BYJL177W YBL029C-AQ3E756 94 aa6.73□□□□□ -1.33
RPL17BYJL177W EDS1P38073 919 aa6.72□□□□□ -1.33
RPL17BYJL177W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RPL17BYJL177W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RPL17BYJL177W PTC3P34221 468 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RPL17BYJL177W SAM3Q08986 587 aa6.68□□□□□ -1.34
RPL17BYJL177W IFH1P39520 1085 aa6.67□□□□□ -1.34
RPL17BYJL177W VNX1P42839 908 aa6.66□□□□□ -1.34
RPL17BYJL177W YPR148CQ06523 435 aa6.65□□□□□ -1.34
RPL17BYJL177W WSC3Q12215 556 aa6.65□□□□□ -1.34
RPL17BYJL177W VPS70P47161 811 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL17BYJL177W GYP5Q12344 894 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL17BYJL177W ATH1P48016 1211 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL17BYJL177W YOL036WQ08206 761 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL17BYJL177W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPL17BYJL177W SET4P42948 560 aa6.61□□□□□ -1.35
RPL17BYJL177W GUT1P32190 709 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL17BYJL177W MSB4Q12317 492 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL17BYJL177W CKB1P43639 278 aa6.58□□□□□ -1.36
RPL17BYJL177W SPP1Q03012 353 aa6.58□□□□□ -1.36
RPL17BYJL177W DCW1P36091 449 aa6.57□□□□□ -1.36
RPL17BYJL177W ABP1P15891 592 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RPL17BYJL177W EAP1P36041 632 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RPL17BYJL177W TIF11P38912 153 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RPL17BYJL177W HTA1P04911 132 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.4 ms