RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	FAP1	P53971	965 aa		7.41	□□□□□ -1.22
AI2	Q0055	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
AI2	Q0055	PRY3	P47033	881 aa		6.99	□□□□□ -1.29
AI2	Q0055	AAD16	Q02895	342 aa		6.63	□□□□□ -1.35
AI2	Q0055	PRI1	P10363	409 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AI2	Q0055	YCK3	P39962	524 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AI2	Q0055	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
AI2	Q0055	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AI2	Q0055	ISW2	Q08773	1120 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AI2	Q0055	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
AI2	Q0055	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
AI2	Q0055	MRPL32	P25348	183 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AI2	Q0055	YGL015C	P33199	130 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AI2	Q0055	TFA1	P36100	482 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AI2	Q0055	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AI2	Q0055	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
AI2	Q0055	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AI2	Q0055	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AI2	Q0055	AVT3	P36062	692 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AI2	Q0055	REB1	P21538	810 aa		5.5	□□□□□ -1.53
AI2	Q0055	CDC27	P38042	758 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AI2	Q0055	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
AI2	Q0055	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
AI2	Q0055	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
AI2	Q0055	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
AI2	Q0055	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
AI2	Q0055	UBP9	P39967	754 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AI2	Q0055	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
AI2	Q0055	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
AI2	Q0055	TGL3	P40308	642 aa		5.22	□□□□□ -1.57
AI2	Q0055	TFC8	Q12308	588 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AI2	Q0055	HO	P09932	586 aa		5.14	□□□□□ -1.59
AI2	Q0055	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
AI2	Q0055	SCY1	P53009	804 aa		5.14	□□□□□ -1.59
AI2	Q0055	SPT21	P35209	758 aa		5.14	□□□□□ -1.59
AI2	Q0055	TAF7	Q05021	590 aa		5.13	□□□□□ -1.59
AI2	Q0055	DCD1	P06773	312 aa		5.13	□□□□□ -1.59
AI2	Q0055	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AI2	Q0055	BCH2	P36122	765 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AI2	Q0055	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AI2	Q0055	DMA1	P38823	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AI2	Q0055	MST1	P07236	462 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AI2	Q0055	VNX1	P42839	908 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AI2	Q0055	YOR238W	Q08634	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AI2	Q0055	LEO1	P38439	464 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AI2	Q0055	RIM101	P33400	625 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AI2	Q0055	YJL171C	P46992	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AI2	Q0055	SPP1	Q03012	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AI2	Q0055	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
AI2	Q0055	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
AI2	Q0055	BDF1	P35817	686 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AI2	Q0055	EPS1	P40557	701 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AI2	Q0055	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
AI2	Q0055	FKH1	P40466	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AI2	Q0055	WSC3	Q12215	556 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AI2	Q0055	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
AI2	Q0055	YAP5	P40574	245 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AI2	Q0055	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AI2	Q0055	BMT6	Q12291	365 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI2	Q0055	OXP1	P28273	1286 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AI2	Q0055	LDB19	Q12502	818 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AI2	Q0055	GTT3	P39996	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AI2	Q0055	LEU3	P08638	886 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AI2	Q0055	ULI1	P43604	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI2	Q0055	IOC2	Q12072	812 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI2	Q0055	BBC1	P47068	1157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AI2	Q0055	SSP1	P38871	571 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AI2	Q0055	PTP3	P40048	928 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AI2	Q0055	IFH1	P39520	1085 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI2	Q0055	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AI2	Q0055	YLR271W	Q06152	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI2	Q0055	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AI2	Q0055	AI2	P03876	854 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AI2	Q0055	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
AI2	Q0055	RSM7	P47150	247 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AI2	Q0055	MSB4	Q12317	492 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AI2	Q0055	RTG1	P32607	177 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AI2	Q0055	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
AI2	Q0055	NCR1	Q12200	1170 aa		4.49	□□□□□ -1.69
AI2	Q0055	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	RIP-Chip
AI2	Q0055	DMA2	P53924	522 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AI2	Q0055	PIB1	Q06651	286 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AI2	Q0055	SEC61	P32915	480 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AI2	Q0055	BCK2	P33306	851 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AI2	Q0055	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
AI2	Q0055	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
AI2	Q0055	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
AI2	Q0055	MGA2	P40578	1113 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AI2	Q0055	SET4	P42948	560 aa		4.4	□□□□□ -1.7
AI2	Q0055	YOL036W	Q08206	761 aa		4.4	□□□□□ -1.7
AI2	Q0055	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AI2	Q0055	CST9	Q06032	482 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AI2	Q0055	IOC4	Q04213	475 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AI2	Q0055	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AI2	Q0055	RGA2	Q06407	1009 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AI2	Q0055	SAP30	P38429	201 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AI2	Q0055	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.32	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	PRE3	P38624	215 aa		4.32	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	YPR148C	Q06523	435 aa		4.31	□□□□□ -1.72

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 187.2 ms