RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000642113.1

TMC3-AS1-207, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene TMC3-AS1, Length 2,043 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.75■■□□□ 1.55
TMC3-AS1-207ENST00000642113 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.26■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.97■■□□□ 1.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCC9O60706 1549 aa21.51■■□□□ 1.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.71■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.64■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NACADO15069 1562 aa20.61■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.45■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.41■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-207ENST00000642113 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.32■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SCRIBQ14160 1630 aa20.14■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
TMC3-AS1-207ENST00000642113 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.08■□□□□ 0.8
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.71■□□□□ 0.75
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.71■□□□□ 0.75
TMC3-AS1-207ENST00000642113 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.45■□□□□ 0.7
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.33■□□□□ 0.69
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SMARCA4P51532 1647 aa19.22■□□□□ 0.67
TMC3-AS1-207ENST00000642113 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.14■□□□□ 0.65
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.12■□□□□ 0.65
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.07■□□□□ 0.64
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SMARCA2P51531 1590 aa19.02■□□□□ 0.64
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NCAPD3P42695 1498 aa19.01■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.98■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-207ENST00000642113 WIZO95785 1651 aa18.96■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-207ENST00000642113 HMGXB3Q12766 1538 aa18.94■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-207ENST00000642113 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NESP48681 1621 aa18.65■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-207ENST00000642113 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.53■□□□□ 0.56
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ERCC6Q03468 1493 aa18.49■□□□□ 0.55
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.48■□□□□ 0.55
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.47■□□□□ 0.55
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.46■□□□□ 0.55
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CFTRP13569 1480 aa18.38■□□□□ 0.53
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.37■□□□□ 0.53
TMC3-AS1-207ENST00000642113 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PRDM2Q13029 1718 aa18.33■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.29■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.25■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CUX2O14529 1486 aa18.22■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.21■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-207ENST00000642113 WDR62O43379 1518 aa18.16■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-207ENST00000642113 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FOXD1Q16676 465 aa18.13■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ADRA2BP18089 450 aa18.12■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.05■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TOPBP1Q92547 1522 aa18.02■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.99■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCC8Q09428 1581 aa17.93■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CUX1P39880 1505 aa17.92■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-207ENST00000642113 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.85■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-207ENST00000642113 IFT140Q96RY7 1462 aa17.84■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.83■□□□□ 0.44
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SYNJ1O43426 1573 aa17.81■□□□□ 0.44
TMC3-AS1-207ENST00000642113 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.44
TMC3-AS1-207ENST00000642113 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.77■□□□□ 0.44
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SOGA1O94964 1423 aa17.77■□□□□ 0.44
TMC3-AS1-207ENST00000642113 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TOP2BQ02880 1626 aa17.76■□□□□ 0.43
TMC3-AS1-207ENST00000642113 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.43
TMC3-AS1-207ENST00000642113 WDR97A6NE52 1622 aa17.73■□□□□ 0.43
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.63■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.62■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PBRM1Q86U86 1689 aa17.61■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.6■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CHD1O14646 1710 aa17.58■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-207ENST00000642113 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.57■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.56■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-207ENST00000642113 GRIN2BQ13224 1484 aa17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FBLN2P98095 1184 aa17.51■□□□□ 0.39
TMC3-AS1-207ENST00000642113 OSCARQ8IYS5 282 aa17.48■□□□□ 0.39
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KCNA4P22459 653 aa17.47■□□□□ 0.39
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SYNJ2O15056 1496 aa17.43■□□□□ 0.38
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ADAMTS12P58397 1594 aa17.43■□□□□ 0.38
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.42■□□□□ 0.38
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TRIM41Q8WV44 630 aa17.41■□□□□ 0.38
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIF27Q86VH2 1401 aa17.39■□□□□ 0.37
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.37■□□□□ 0.37
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.35■□□□□ 0.37
TMC3-AS1-207ENST00000642113 GRIN2AQ12879 1464 aa17.35■□□□□ 0.37
TMC3-AS1-207ENST00000642113 IGF1RP08069 1367 aa17.33■□□□□ 0.36
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.31■□□□□ 0.36
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CEP170Q5SW79 1584 aa17.3■□□□□ 0.36
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CUL7Q14999 1698 aa17.3■□□□□ 0.36
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.29■□□□□ 0.36
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