RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		16.25	■□□□□ 0.19
SAMMSON-222	ENST00000641901	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
SAMMSON-222	ENST00000641901	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SAMMSON-222	ENST00000641901	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SAMMSON-222	ENST00000641901	ABCC9	O60706	1549 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SAMMSON-222	ENST00000641901	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SAMMSON-222	ENST00000641901	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SAMMSON-222	ENST00000641901	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SAMMSON-222	ENST00000641901	NACAD	O15069	1562 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SAMMSON-222	ENST00000641901	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SAMMSON-222	ENST00000641901	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SAMMSON-222	ENST00000641901	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SAMMSON-222	ENST00000641901	SCRIB	Q14160	1630 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SAMMSON-222	ENST00000641901	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
SAMMSON-222	ENST00000641901	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SAMMSON-222	ENST00000641901	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SAMMSON-222	ENST00000641901	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SAMMSON-222	ENST00000641901	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SAMMSON-222	ENST00000641901	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SAMMSON-222	ENST00000641901	SMARCA4	P51532	1647 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SAMMSON-222	ENST00000641901	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SAMMSON-222	ENST00000641901	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SAMMSON-222	ENST00000641901	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	WIZ	O95785	1651 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	SMARCA2	P51531	1590 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	NCAPD3	P42695	1498 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	HMGXB3	Q12766	1538 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SAMMSON-222	ENST00000641901	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SAMMSON-222	ENST00000641901	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SAMMSON-222	ENST00000641901	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRIM41	Q8WV44	630 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SAMMSON-222	ENST00000641901	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SAMMSON-222	ENST00000641901	NES	P48681	1621 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SAMMSON-222	ENST00000641901	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		12.15	□□□□□ -0.47
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SAMMSON-222	ENST00000641901	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SAMMSON-222	ENST00000641901	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SAMMSON-222	ENST00000641901	HRC	P23327	699 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SAMMSON-222	ENST00000641901	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SAMMSON-222	ENST00000641901	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SAMMSON-222	ENST00000641901	ABCC8	Q09428	1581 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SAMMSON-222	ENST00000641901	ERCC6	Q03468	1493 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SAMMSON-222	ENST00000641901	CFTR	P13569	1480 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SAMMSON-222	ENST00000641901	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRDM2	Q13029	1718 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SAMMSON-222	ENST00000641901	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SAMMSON-222	ENST00000641901	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SAMMSON-222	ENST00000641901	SYNJ1	O43426	1573 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SAMMSON-222	ENST00000641901	WDR62	O43379	1518 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SAMMSON-222	ENST00000641901	SOGA1	O94964	1423 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SAMMSON-222	ENST00000641901	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	11.81	□□□□□ -0.52
SAMMSON-222	ENST00000641901	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SAMMSON-222	ENST00000641901	CUX2	O14529	1486 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SAMMSON-222	ENST00000641901	TOPBP1	Q92547	1522 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SAMMSON-222	ENST00000641901	CUX1	P39880	1505 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SAMMSON-222	ENST00000641901	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SAMMSON-222	ENST00000641901	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		11.71	□□□□□ -0.54
SAMMSON-222	ENST00000641901	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SAMMSON-222	ENST00000641901	EEA1	Q15075	1411 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SAMMSON-222	ENST00000641901	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SAMMSON-222	ENST00000641901	CEP162	Q5TB80	1403 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SAMMSON-222	ENST00000641901	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SAMMSON-222	ENST00000641901	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SAMMSON-222	ENST00000641901	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SAMMSON-222	ENST00000641901	IFT140	Q96RY7	1462 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SAMMSON-222	ENST00000641901	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SAMMSON-222	ENST00000641901	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SAMMSON-222	ENST00000641901	GOLGA3	Q08378	1498 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SAMMSON-222	ENST00000641901	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SAMMSON-222	ENST00000641901	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SAMMSON-222	ENST00000641901	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55
SAMMSON-222	ENST00000641901	WDR97	A6NE52	1622 aa		11.59	□□□□□ -0.55
SAMMSON-222	ENST00000641901	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
SAMMSON-222	ENST00000641901	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SAMMSON-222	ENST00000641901	KIF21B	O75037	1637 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SAMMSON-222	ENST00000641901	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SAMMSON-222	ENST00000641901	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SAMMSON-222	ENST00000641901	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.52	□□□□□ -0.56
SAMMSON-222	ENST00000641901	PBRM1	Q86U86	1689 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SAMMSON-222	ENST00000641901	CLIP1	P30622	1438 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SAMMSON-222	ENST00000641901	GRIN2B	Q13224	1484 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SAMMSON-222	ENST00000641901	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SAMMSON-222	ENST00000641901	FOXD1	Q16676	465 aa		11.48	□□□□□ -0.57

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