RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639560.1

TNNT3-215, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

TSL 5

Gene TNNT3, Length 878 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-215ENST00000639560 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.48■■■□□ 2.31
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TNNT3-215ENST00000639560 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.76■■□□□ 1.87
TNNT3-215ENST00000639560 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.31■■□□□ 1.8
TNNT3-215ENST00000639560 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.78■■□□□ 1.72
TNNT3-215ENST00000639560 NACADO15069 1562 aa25.44■■□□□ 1.66
TNNT3-215ENST00000639560 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
TNNT3-215ENST00000639560 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.2■■□□□ 1.62
TNNT3-215ENST00000639560 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.1■■□□□ 1.61
TNNT3-215ENST00000639560 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.05■■□□□ 1.6
TNNT3-215ENST00000639560 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.9■■□□□ 1.58
TNNT3-215ENST00000639560 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.76■■□□□ 1.55
TNNT3-215ENST00000639560 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.72■■□□□ 1.55
TNNT3-215ENST00000639560 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.69■■□□□ 1.54
TNNT3-215ENST00000639560 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.62■■□□□ 1.53
TNNT3-215ENST00000639560 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TNNT3-215ENST00000639560 SCRIBQ14160 1630 aa24.33■■□□□ 1.49
TNNT3-215ENST00000639560 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.32■■□□□ 1.48
TNNT3-215ENST00000639560 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TNNT3-215ENST00000639560 CUX2O14529 1486 aa23.91■■□□□ 1.42
TNNT3-215ENST00000639560 ERCC6Q03468 1493 aa23.68■■□□□ 1.38
TNNT3-215ENST00000639560 NCAPD3P42695 1498 aa23.5■■□□□ 1.35
TNNT3-215ENST00000639560 NESP48681 1621 aa23.36■■□□□ 1.33
TNNT3-215ENST00000639560 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.35■■□□□ 1.33
TNNT3-215ENST00000639560 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TNNT3-215ENST00000639560 HMGXB3Q12766 1538 aa23.28■■□□□ 1.32
TNNT3-215ENST00000639560 TRIM41Q8WV44 630 aa23.23■■□□□ 1.31
TNNT3-215ENST00000639560 SMARCA2P51531 1590 aa23.23■■□□□ 1.31
TNNT3-215ENST00000639560 SMARCA4P51532 1647 aa23.15■■□□□ 1.3
TNNT3-215ENST00000639560 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.08■■□□□ 1.29
TNNT3-215ENST00000639560 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TNNT3-215ENST00000639560 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.02■■□□□ 1.28
TNNT3-215ENST00000639560 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.95■■□□□ 1.26
TNNT3-215ENST00000639560 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.94■■□□□ 1.26
TNNT3-215ENST00000639560 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TNNT3-215ENST00000639560 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.82■■□□□ 1.24
TNNT3-215ENST00000639560 WDR62O43379 1518 aa22.81■■□□□ 1.24
TNNT3-215ENST00000639560 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.74■■□□□ 1.23
TNNT3-215ENST00000639560 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.72■■□□□ 1.23
TNNT3-215ENST00000639560 OSCARQ8IYS5 282 aa22.62■■□□□ 1.21
TNNT3-215ENST00000639560 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.58■■□□□ 1.2
TNNT3-215ENST00000639560 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.5■■□□□ 1.19
TNNT3-215ENST00000639560 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.48■■□□□ 1.19
TNNT3-215ENST00000639560 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.48■■□□□ 1.19
TNNT3-215ENST00000639560 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.48■■□□□ 1.19
TNNT3-215ENST00000639560 WIZO95785 1651 aa22.39■■□□□ 1.18
TNNT3-215ENST00000639560 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TNNT3-215ENST00000639560 CFTRP13569 1480 aa22.36■■□□□ 1.17
TNNT3-215ENST00000639560 ARHGEF11O15085 1522 aa22.35■■□□□ 1.17
TNNT3-215ENST00000639560 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TNNT3-215ENST00000639560 IFT140Q96RY7 1462 aa22.15■■□□□ 1.14
TNNT3-215ENST00000639560 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.14■■□□□ 1.13
TNNT3-215ENST00000639560 ARAP1Q96P48 1450 aa22.09■■□□□ 1.13
TNNT3-215ENST00000639560 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TNNT3-215ENST00000639560 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TNNT3-215ENST00000639560 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TNNT3-215ENST00000639560 PRDM2Q13029 1718 aa22.06■■□□□ 1.12
TNNT3-215ENST00000639560 TOPBP1Q92547 1522 aa22.01■■□□□ 1.11
TNNT3-215ENST00000639560 CHD1O14646 1710 aa21.99■■□□□ 1.11
TNNT3-215ENST00000639560 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TNNT3-215ENST00000639560 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TNNT3-215ENST00000639560 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
TNNT3-215ENST00000639560 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TNNT3-215ENST00000639560 ABCC8Q09428 1581 aa21.87■■□□□ 1.09
TNNT3-215ENST00000639560 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.86■■□□□ 1.09
TNNT3-215ENST00000639560 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.82■■□□□ 1.08
TNNT3-215ENST00000639560 FBLN2P98095 1184 aa21.81■■□□□ 1.08
TNNT3-215ENST00000639560 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.77■■□□□ 1.08
TNNT3-215ENST00000639560 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TNNT3-215ENST00000639560 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.67■■□□□ 1.06
TNNT3-215ENST00000639560 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.66■■□□□ 1.06
TNNT3-215ENST00000639560 SYNJ1O43426 1573 aa21.65■■□□□ 1.06
TNNT3-215ENST00000639560 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
TNNT3-215ENST00000639560 WDR97A6NE52 1622 aa21.59■■□□□ 1.05
TNNT3-215ENST00000639560 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TNNT3-215ENST00000639560 SOGA1O94964 1423 aa21.58■■□□□ 1.05
TNNT3-215ENST00000639560 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TNNT3-215ENST00000639560 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.55■■□□□ 1.04
TNNT3-215ENST00000639560 SYNJ2O15056 1496 aa21.52■■□□□ 1.03
TNNT3-215ENST00000639560 GRIN2BQ13224 1484 aa21.5■■□□□ 1.03
TNNT3-215ENST00000639560 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.5■■□□□ 1.03
TNNT3-215ENST00000639560 CUX1P39880 1505 aa21.39■■□□□ 1.01
TNNT3-215ENST00000639560 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.37■■□□□ 1.01
TNNT3-215ENST00000639560 PBRM1Q86U86 1689 aa21.37■■□□□ 1.01
TNNT3-215ENST00000639560 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.27■■□□□ 1
TNNT3-215ENST00000639560 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.26■□□□□ 0.99
TNNT3-215ENST00000639560 CEP170Q5SW79 1584 aa21.26■□□□□ 0.99
TNNT3-215ENST00000639560 GRIN2AQ12879 1464 aa21.24■□□□□ 0.99
TNNT3-215ENST00000639560 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.23■□□□□ 0.99
TNNT3-215ENST00000639560 NUP160Q12769 1436 aa21.21■□□□□ 0.99
TNNT3-215ENST00000639560 SHROOM2Q13796 1616 aa21.19■□□□□ 0.98
TNNT3-215ENST00000639560 ADAMTS12P58397 1594 aa21.17■□□□□ 0.98
TNNT3-215ENST00000639560 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
TNNT3-215ENST00000639560 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.07■□□□□ 0.96
TNNT3-215ENST00000639560 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.07■□□□□ 0.96
TNNT3-215ENST00000639560 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.04■□□□□ 0.96
TNNT3-215ENST00000639560 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.02■□□□□ 0.96
TNNT3-215ENST00000639560 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
TNNT3-215ENST00000639560 DIP2BQ9P265 1576 aa21.02■□□□□ 0.95
TNNT3-215ENST00000639560 MAPKBP1O60336 1514 aa21.01■□□□□ 0.95
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