RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636951.1

LIN28B-AS1-204, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LIN28B-AS1, Length 610 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.71■■■□□ 2.35
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.4■■□□□ 1.82
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ABCC9O60706 1549 aa25.88■■□□□ 1.73
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25■■□□□ 1.59
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.9■■□□□ 1.58
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 NACADO15069 1562 aa24.86■■□□□ 1.57
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.68■■□□□ 1.54
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.57■■□□□ 1.52
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.26■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 SCRIBQ14160 1630 aa24.11■■□□□ 1.45
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.05■■□□□ 1.44
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.87■■□□□ 1.41
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.7■■□□□ 1.38
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.38■■□□□ 1.33
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.26■■□□□ 1.31
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 SMARCA4P51532 1647 aa23.04■■□□□ 1.28
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 SMARCA2P51531 1590 aa22.94■■□□□ 1.26
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.93■■□□□ 1.26
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 NCAPD3P42695 1498 aa22.92■■□□□ 1.26
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.89■■□□□ 1.25
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 HMGXB3Q12766 1538 aa22.8■■□□□ 1.24
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.8■■□□□ 1.24
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 WIZO95785 1651 aa22.65■■□□□ 1.22
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ERCC6Q03468 1493 aa22.37■■□□□ 1.17
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 NESP48681 1621 aa22.35■■□□□ 1.17
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.33■■□□□ 1.17
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.29■■□□□ 1.16
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.16■■□□□ 1.14
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CFTRP13569 1480 aa22.12■■□□□ 1.13
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.09■■□□□ 1.13
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CUX2O14529 1486 aa22.07■■□□□ 1.12
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.03■■□□□ 1.12
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 PRDM2Q13029 1718 aa21.95■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 WDR62O43379 1518 aa21.85■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ABCC8Q09428 1581 aa21.72■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 TOPBP1Q92547 1522 aa21.66■■□□□ 1.06
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.63■■□□□ 1.05
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 IFT140Q96RY7 1462 aa21.55■■□□□ 1.04
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CUX1P39880 1505 aa21.47■■□□□ 1.03
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 SOGA1O94964 1423 aa21.44■■□□□ 1.02
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.43■■□□□ 1.02
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.41■■□□□ 1.02
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.39■■□□□ 1.01
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 TOP2BQ02880 1626 aa21.3■■□□□ 1
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.29■■□□□ 1
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 SYNJ1O43426 1573 aa21.27■■□□□ 1
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 WDR97A6NE52 1622 aa21.26■□□□□ 0.99
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 OSCARQ8IYS5 282 aa21.23■□□□□ 0.99
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.21■□□□□ 0.99
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 FBLN2P98095 1184 aa21.18■□□□□ 0.98
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 GRIN2BQ13224 1484 aa21.17■□□□□ 0.98
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.17■□□□□ 0.98
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.12■□□□□ 0.97
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.09■□□□□ 0.97
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 PBRM1Q86U86 1689 aa21.09■□□□□ 0.97
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CHD1O14646 1710 aa21.06■□□□□ 0.96
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 SYNJ2O15056 1496 aa21.02■□□□□ 0.96
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 TRIM41Q8WV44 630 aa20.98■□□□□ 0.95
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 KIF27Q86VH2 1401 aa20.97■□□□□ 0.95
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.97■□□□□ 0.95
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.93■□□□□ 0.94
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ADAMTS12P58397 1594 aa20.9■□□□□ 0.94
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 GRIN2AQ12879 1464 aa20.88■□□□□ 0.93
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 IGF1RP08069 1367 aa20.85■□□□□ 0.93
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 ARHGEF11O15085 1522 aa20.8■□□□□ 0.92
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.8■□□□□ 0.92
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.79■□□□□ 0.92
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.79■□□□□ 0.92
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.79■□□□□ 0.92
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CUL7Q14999 1698 aa20.79■□□□□ 0.92
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 NUP160Q12769 1436 aa20.76■□□□□ 0.91
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.75■□□□□ 0.91
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CEP170Q5SW79 1584 aa20.73■□□□□ 0.91
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.71■□□□□ 0.91
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.7■□□□□ 0.9
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.66■□□□□ 0.9
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 JPH4Q96JJ6 628 aa20.63■□□□□ 0.89
LIN28B-AS1-204ENST00000636951 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms