RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636652.1

CHRNA4-216, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 195 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-216ENST00000636652 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.54■■■□□ 2.64
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.79■■■□□ 2.04
CHRNA4-216ENST00000636652 ABCC9O60706 1549 aa26.69■■□□□ 1.86
CHRNA4-216ENST00000636652 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CHRNA4-216ENST00000636652 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.15■■□□□ 1.78
CHRNA4-216ENST00000636652 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.08■■□□□ 1.77
CHRNA4-216ENST00000636652 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.07■■□□□ 1.76
CHRNA4-216ENST00000636652 NACADO15069 1562 aa26.03■■□□□ 1.76
CHRNA4-216ENST00000636652 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.92■■□□□ 1.74
CHRNA4-216ENST00000636652 SCRIBQ14160 1630 aa25.38■■□□□ 1.65
CHRNA4-216ENST00000636652 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.23■■□□□ 1.63
CHRNA4-216ENST00000636652 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.18■■□□□ 1.62
CHRNA4-216ENST00000636652 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.1■■□□□ 1.61
CHRNA4-216ENST00000636652 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
CHRNA4-216ENST00000636652 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.48■■□□□ 1.51
CHRNA4-216ENST00000636652 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CHRNA4-216ENST00000636652 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CHRNA4-216ENST00000636652 SMARCA4P51532 1647 aa24.34■■□□□ 1.49
CHRNA4-216ENST00000636652 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.29■■□□□ 1.48
CHRNA4-216ENST00000636652 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CHRNA4-216ENST00000636652 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.15■■□□□ 1.46
CHRNA4-216ENST00000636652 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.12■■□□□ 1.45
CHRNA4-216ENST00000636652 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.1■■□□□ 1.45
CHRNA4-216ENST00000636652 SMARCA2P51531 1590 aa24.1■■□□□ 1.45
CHRNA4-216ENST00000636652 WIZO95785 1651 aa24.02■■□□□ 1.44
CHRNA4-216ENST00000636652 NCAPD3P42695 1498 aa24.01■■□□□ 1.43
CHRNA4-216ENST00000636652 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.99■■□□□ 1.43
CHRNA4-216ENST00000636652 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4-216ENST00000636652 HMGXB3Q12766 1538 aa23.95■■□□□ 1.43
CHRNA4-216ENST00000636652 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4-216ENST00000636652 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.56■■□□□ 1.36
CHRNA4-216ENST00000636652 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.34■■□□□ 1.33
CHRNA4-216ENST00000636652 CFTRP13569 1480 aa23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4-216ENST00000636652 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.29■■□□□ 1.32
CHRNA4-216ENST00000636652 NESP48681 1621 aa23.23■■□□□ 1.31
CHRNA4-216ENST00000636652 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.13■■□□□ 1.29
CHRNA4-216ENST00000636652 PRDM2Q13029 1718 aa23.1■■□□□ 1.29
CHRNA4-216ENST00000636652 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.07■■□□□ 1.28
CHRNA4-216ENST00000636652 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4-216ENST00000636652 ERCC6Q03468 1493 aa22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4-216ENST00000636652 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4-216ENST00000636652 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.85■■□□□ 1.25
CHRNA4-216ENST00000636652 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4-216ENST00000636652 ABCC8Q09428 1581 aa22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4-216ENST00000636652 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CHRNA4-216ENST00000636652 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4-216ENST00000636652 CUX1P39880 1505 aa22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4-216ENST00000636652 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4-216ENST00000636652 WDR62O43379 1518 aa22.76■■□□□ 1.23
CHRNA4-216ENST00000636652 TOPBP1Q92547 1522 aa22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4-216ENST00000636652 SYNJ1O43426 1573 aa22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4-216ENST00000636652 TOP2BQ02880 1626 aa22.71■■□□□ 1.23
CHRNA4-216ENST00000636652 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.69■■□□□ 1.22
CHRNA4-216ENST00000636652 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIM41Q8WV44 630 aa22.63■■□□□ 1.21
CHRNA4-216ENST00000636652 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.62■■□□□ 1.21
CHRNA4-216ENST00000636652 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4-216ENST00000636652 CUX2O14529 1486 aa22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4-216ENST00000636652 SOGA1O94964 1423 aa22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4-216ENST00000636652 IFT140Q96RY7 1462 aa22.5■■□□□ 1.19
CHRNA4-216ENST00000636652 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.47■■□□□ 1.19
CHRNA4-216ENST00000636652 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4-216ENST00000636652 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4-216ENST00000636652 WDR97A6NE52 1622 aa22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4-216ENST00000636652 KIF27Q86VH2 1401 aa22.32■■□□□ 1.16
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CHRNA4-216ENST00000636652 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CHRNA4-216ENST00000636652 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4-216ENST00000636652 EEA1Q15075 1411 aa22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4-216ENST00000636652 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4-216ENST00000636652 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4-216ENST00000636652 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4-216ENST00000636652 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.22■■□□□ 1.15
CHRNA4-216ENST00000636652 GRIN2BQ13224 1484 aa22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4-216ENST00000636652 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4-216ENST00000636652 IGF1RP08069 1367 aa22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4-216ENST00000636652 PBRM1Q86U86 1689 aa22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4-216ENST00000636652 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4-216ENST00000636652 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4-216ENST00000636652 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4-216ENST00000636652 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4-216ENST00000636652 CUL7Q14999 1698 aa22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4-216ENST00000636652 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4-216ENST00000636652 ADAMTS12P58397 1594 aa22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4-216ENST00000636652 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4-216ENST00000636652 PRXQ9BXM0 1461 aa22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4-216ENST00000636652 SYNJ2O15056 1496 aa21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4-216ENST00000636652 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4-216ENST00000636652 KIF21BO75037 1637 aa21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4-216ENST00000636652 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4-216ENST00000636652 GRIN2AQ12879 1464 aa21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4-216ENST00000636652 GOLGA3Q08378 1498 aa21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4-216ENST00000636652 FBLN2P98095 1184 aa21.87■■□□□ 1.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CHD1O14646 1710 aa21.83■■□□□ 1.08
CHRNA4-216ENST00000636652 NUP160Q12769 1436 aa21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4-216ENST00000636652 CEP170Q5SW79 1584 aa21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4-216ENST00000636652 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4-216ENST00000636652 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4-216ENST00000636652 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.72■■□□□ 1.07
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