RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634609.1

QARS-232, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene QARS, Length 553 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QARS-232ENST00000634609 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.27■■■□□ 2.92
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QARS-232ENST00000634609 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.46■■□□□ 1.99
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QARS-232ENST00000634609 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.35■■□□□ 1.97
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QARS-232ENST00000634609 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.72■■□□□ 1.87
QARS-232ENST00000634609 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.64■■□□□ 1.86
QARS-232ENST00000634609 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.51■■□□□ 1.83
QARS-232ENST00000634609 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.832e-7■■■■■ 27.8
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QARS-232ENST00000634609 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
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QARS-232ENST00000634609 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.43■■□□□ 1.66
QARS-232ENST00000634609 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.42■■□□□ 1.66
QARS-232ENST00000634609 SMARCA2P51531 1590 aa25.41■■□□□ 1.66
QARS-232ENST00000634609 WIZO95785 1651 aa25.4■■□□□ 1.66
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QARS-232ENST00000634609 CFTRP13569 1480 aa24.59■■□□□ 1.53
QARS-232ENST00000634609 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.57■■□□□ 1.52
QARS-232ENST00000634609 NESP48681 1621 aa24.57■■□□□ 1.52
QARS-232ENST00000634609 CUX2O14529 1486 aa24.48■■□□□ 1.51
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QARS-232ENST00000634609 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.41■■□□□ 1.5
QARS-232ENST00000634609 PRDM2Q13029 1718 aa24.4■■□□□ 1.5
QARS-232ENST00000634609 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.34■■□□□ 1.49
QARS-232ENST00000634609 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.26■■□□□ 1.47
QARS-232ENST00000634609 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.26■■□□□ 1.47
QARS-232ENST00000634609 ABCC8Q09428 1581 aa24.12■■□□□ 1.45
QARS-232ENST00000634609 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.11■■□□□ 1.45
QARS-232ENST00000634609 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
QARS-232ENST00000634609 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
QARS-232ENST00000634609 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
QARS-232ENST00000634609 CUX1P39880 1505 aa24.04■■□□□ 1.44
QARS-232ENST00000634609 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.02■■□□□ 1.44
QARS-232ENST00000634609 TOPBP1Q92547 1522 aa24.01■■□□□ 1.43
QARS-232ENST00000634609 WDR62O43379 1518 aa24■■□□□ 1.43
QARS-232ENST00000634609 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.98■■□□□ 1.43
QARS-232ENST00000634609 SYNJ1O43426 1573 aa23.98■■□□□ 1.43
QARS-232ENST00000634609 TOP2BQ02880 1626 aa23.95■■□□□ 1.43
QARS-232ENST00000634609 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.94■■□□□ 1.42
QARS-232ENST00000634609 TRIM41Q8WV44 630 aa23.92■■□□□ 1.42
QARS-232ENST00000634609 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.87■■□□□ 1.41
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QARS-232ENST00000634609 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.75■■□□□ 1.39
QARS-232ENST00000634609 IFT140Q96RY7 1462 aa23.73■■□□□ 1.39
QARS-232ENST00000634609 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
QARS-232ENST00000634609 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.66■■□□□ 1.38
QARS-232ENST00000634609 WDR97A6NE52 1622 aa23.61■■□□□ 1.37
QARS-232ENST00000634609 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
QARS-232ENST00000634609 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
QARS-232ENST00000634609 KIF27Q86VH2 1401 aa23.54■■□□□ 1.36
QARS-232ENST00000634609 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.364e-9■■■■□ 20.9
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QARS-232ENST00000634609 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.5■■□□□ 1.35
QARS-232ENST00000634609 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.5■■□□□ 1.35
QARS-232ENST00000634609 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
QARS-232ENST00000634609 EEA1Q15075 1411 aa23.44■■□□□ 1.34
QARS-232ENST00000634609 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
QARS-232ENST00000634609 GRIN2BQ13224 1484 aa23.42■■□□□ 1.34
QARS-232ENST00000634609 OSCARQ8IYS5 282 aa23.41■■□□□ 1.34
QARS-232ENST00000634609 IGF1RP08069 1367 aa23.4■■□□□ 1.34
QARS-232ENST00000634609 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.38■■□□□ 1.33
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QARS-232ENST00000634609 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.3■■□□□ 1.32
QARS-232ENST00000634609 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
QARS-232ENST00000634609 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.27■■□□□ 1.32
QARS-232ENST00000634609 CUL7Q14999 1698 aa23.25■■□□□ 1.31
QARS-232ENST00000634609 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.25■■□□□ 1.31
QARS-232ENST00000634609 ADAMTS12P58397 1594 aa23.23■■□□□ 1.31
QARS-232ENST00000634609 PRXQ9BXM0 1461 aa23.23■■□□□ 1.31
QARS-232ENST00000634609 SYNJ2O15056 1496 aa23.2■■□□□ 1.3
QARS-232ENST00000634609 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
QARS-232ENST00000634609 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.17■■□□□ 1.3
QARS-232ENST00000634609 FBLN2P98095 1184 aa23.17■■□□□ 1.3
QARS-232ENST00000634609 KIF21BO75037 1637 aa23.14■■□□□ 1.29
QARS-232ENST00000634609 GRIN2AQ12879 1464 aa23.11■■□□□ 1.29
QARS-232ENST00000634609 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.1■■□□□ 1.29
QARS-232ENST00000634609 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.1■■□□□ 1.29
QARS-232ENST00000634609 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.1■■□□□ 1.29
QARS-232ENST00000634609 CHD1O14646 1710 aa23.09■■□□□ 1.29
QARS-232ENST00000634609 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.07■■□□□ 1.28
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