RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626574.2

PCBP1-AS1-296, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 887 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.52■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.05■□□□□ 0.48
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCC9O60706 1549 aa17.42■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.2■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.96■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NACADO15069 1562 aa16.94■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.91■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.89■□□□□ 0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SCRIBQ14160 1630 aa16.56■□□□□ 0.24
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.51■□□□□ 0.23
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.43■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.3■□□□□ 0.2
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.96■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SMARCA4P51532 1647 aa15.83■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.82■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.74■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SMARCA2P51531 1590 aa15.7■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.69■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.68■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 WIZO95785 1651 aa15.67■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.64■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NCAPD3P42695 1498 aa15.63■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 HMGXB3Q12766 1538 aa15.55■□□□□ 0.08
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.36■□□□□ 0.05
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.24■□□□□ 0.03
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CFTRP13569 1480 aa15.17■□□□□ 0.02
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.16■□□□□ 0.02
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NESP48681 1621 aa15.16■□□□□ 0.02
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.1■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.04■□□□□ -0
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ERCC6Q03468 1493 aa15.03■□□□□ -0
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PRDM2Q13029 1718 aa15.03■□□□□ -0
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.99□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.94□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.89□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCC8Q09428 1581 aa14.89□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.86□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TRIM41Q8WV44 630 aa14.86□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CUX1P39880 1505 aa14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TOPBP1Q92547 1522 aa14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TOP2BQ02880 1626 aa14.78□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SYNJ1O43426 1573 aa14.78□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 WDR62O43379 1518 aa14.78□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.75□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.74□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SOGA1O94964 1423 aa14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CUX2O14529 1486 aa14.69□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 IFT140Q96RY7 1462 aa14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.6□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIF27Q86VH2 1401 aa14.58□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 EEA1Q15075 1411 aa14.52□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 WDR97A6NE52 1622 aa14.52□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.51□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 GRIN2BQ13224 1484 aa14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 IGF1RP08069 1367 aa14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.43□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PBRM1Q86U86 1689 aa14.42□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FBLN2P98095 1184 aa14.41□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.41□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.4□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.38□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.37□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CUL7Q14999 1698 aa14.36□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.34□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SYNJ2O15056 1496 aa14.33□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ADAMTS12P58397 1594 aa14.33□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PRXQ9BXM0 1461 aa14.32□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIF21BO75037 1637 aa14.29□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 GOLGA3Q08378 1498 aa14.28□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 GRIN2AQ12879 1464 aa14.27□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.27□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 OSCARQ8IYS5 282 aa14.25□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CHD1O14646 1710 aa14.24□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NUP160Q12769 1436 aa14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms