RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612516.4

CCL23-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL23, Length 569 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-201ENST00000612516 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.71□□□□□ -0.05
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CCL23-201ENST00000612516 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.45□□□□□ -0.42
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CCL23-201ENST00000612516 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.16□□□□□ -0.62
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CCL23-201ENST00000612516 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CCL23-201ENST00000612516 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.04□□□□□ -0.64
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CCL23-201ENST00000612516 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.99□□□□□ -0.65
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CCL23-201ENST00000612516 PRDM2Q13029 1718 aa10.87□□□□□ -0.67
CCL23-201ENST00000612516 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
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CCL23-201ENST00000612516 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
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CCL23-201ENST00000612516 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.65□□□□□ -0.7
CCL23-201ENST00000612516 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CCL23-201ENST00000612516 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CCL23-201ENST00000612516 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CCL23-201ENST00000612516 CUX1P39880 1505 aa10.63□□□□□ -0.71
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CCL23-201ENST00000612516 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CCL23-201ENST00000612516 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
CCL23-201ENST00000612516 WDR97A6NE52 1622 aa10.56□□□□□ -0.72
CCL23-201ENST00000612516 GRIN2BQ13224 1484 aa10.55□□□□□ -0.72
CCL23-201ENST00000612516 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.54□□□□□ -0.72
CCL23-201ENST00000612516 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.54□□□□□ -0.72
CCL23-201ENST00000612516 CHD1O14646 1710 aa10.53□□□□□ -0.72
CCL23-201ENST00000612516 TOP2BQ02880 1626 aa10.52□□□□□ -0.73
CCL23-201ENST00000612516 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CCL23-201ENST00000612516 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.52□□□□□ -0.73
CCL23-201ENST00000612516 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.51□□□□□ -0.73
CCL23-201ENST00000612516 SYNJ1O43426 1573 aa10.5□□□□□ -0.73
CCL23-201ENST00000612516 SYNJ2O15056 1496 aa10.49□□□□□ -0.73
CCL23-201ENST00000612516 PBRM1Q86U86 1689 aa10.48□□□□□ -0.73
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CCL23-201ENST00000612516 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.47□□□□□ -0.73
CCL23-201ENST00000612516 ARHGEF11O15085 1522 aa10.46□□□□□ -0.74
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CCL23-201ENST00000612516 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.39□□□□□ -0.75
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CCL23-201ENST00000612516 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CCL23-201ENST00000612516 ARAP1Q96P48 1450 aa10.36□□□□□ -0.75
CCL23-201ENST00000612516 NUP160Q12769 1436 aa10.33□□□□□ -0.76
CCL23-201ENST00000612516 IGF1RP08069 1367 aa10.33□□□□□ -0.76
CCL23-201ENST00000612516 CEP170Q5SW79 1584 aa10.32□□□□□ -0.76
CCL23-201ENST00000612516 JPH4Q96JJ6 628 aa10.32□□□□□ -0.76
CCL23-201ENST00000612516 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.29□□□□□ -0.76
CCL23-201ENST00000612516 CUL7Q14999 1698 aa10.29□□□□□ -0.76
CCL23-201ENST00000612516 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
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