RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611848.1

SMAD4-217, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,648 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-217ENST00000611848 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.12■□□□□ 0.97
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SMAD4-217ENST00000611848 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.6■□□□□ 0.41
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SMAD4-217ENST00000611848 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.49■□□□□ 0.23
SMAD4-217ENST00000611848 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.41■□□□□ 0.22
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SMAD4-217ENST00000611848 SMARCA2P51531 1590 aa16.25■□□□□ 0.19
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SMAD4-217ENST00000611848 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.15■□□□□ 0.02
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SMAD4-217ENST00000611848 WDR97A6NE52 1622 aa15.08■□□□□ 0.01
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SMAD4-217ENST00000611848 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.97□□□□□ -0.01
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SMAD4-217ENST00000611848 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.94□□□□□ -0.02
SMAD4-217ENST00000611848 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SMAD4-217ENST00000611848 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.92□□□□□ -0.02
SMAD4-217ENST00000611848 OSCARQ8IYS5 282 aa14.92□□□□□ -0.02
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SMAD4-217ENST00000611848 CHD1O14646 1710 aa14.88□□□□□ -0.03
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SMAD4-217ENST00000611848 CEP170Q5SW79 1584 aa14.68□□□□□ -0.06
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SMAD4-217ENST00000611848 ARHGEF11O15085 1522 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD4-217ENST00000611848 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.63□□□□□ -0.07
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